Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P20040 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P20040 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P20040 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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