Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms