Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhoP15409 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhoP15409 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhoP15409 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhoP15409 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhoP15409 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RhoP15409 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhoP15409 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhoP15409 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhoP15409 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhoP15409 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhoP15409 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhoP15409 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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RhoP15409 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhoP15409 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhoP15409 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RhoP15409 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhoP15409 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhoP15409 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RhoP15409 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhoP15409 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhoP15409 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RhoP15409 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RhoP15409 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RhoP15409 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RhoP15409 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RhoP15409 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RhoP15409 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RhoP15409 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RhoP15409 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhoP15409 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhoP15409 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhoP15409 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhoP15409 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhoP15409 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhoP15409 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhoP15409 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhoP15409 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhoP15409 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RhoP15409 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RhoP15409 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhoP15409 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhoP15409 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhoP15409 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhoP15409 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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