Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrphP15331 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrphP15331 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrphP15331 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrphP15331 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrphP15331 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrphP15331 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrphP15331 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrphP15331 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrphP15331 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrphP15331 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrphP15331 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrphP15331 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrphP15331 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrphP15331 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrphP15331 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrphP15331 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrphP15331 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrphP15331 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrphP15331 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrphP15331 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrphP15331 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrphP15331 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrphP15331 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrphP15331 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrphP15331 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrphP15331 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrphP15331 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrphP15331 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrphP15331 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrphP15331 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrphP15331 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrphP15331 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrphP15331 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrphP15331 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PrphP15331 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrphP15331 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrphP15331 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrphP15331 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrphP15331 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrphP15331 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrphP15331 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrphP15331 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrphP15331 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrphP15331 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrphP15331 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrphP15331 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms