Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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OtcP11725 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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OtcP11725 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OtcP11725 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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OtcP11725 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OtcP11725 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OtcP11725 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OtcP11725 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OtcP11725 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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OtcP11725 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
OtcP11725 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
OtcP11725 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
OtcP11725 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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OtcP11725 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OtcP11725 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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OtcP11725 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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OtcP11725 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtcP11725 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtcP11725 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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OtcP11725 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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OtcP11725 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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OtcP11725 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtcP11725 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtcP11725 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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OtcP11725 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtcP11725 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtcP11725 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtcP11725 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtcP11725 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtcP11725 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtcP11725 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtcP11725 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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OtcP11725 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtcP11725 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtcP11725 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtcP11725 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtcP11725 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtcP11725 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtcP11725 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtcP11725 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
OtcP11725 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtcP11725 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtcP11725 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtcP11725 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtcP11725 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtcP11725 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtcP11725 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtcP11725 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtcP11725 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtcP11725 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtcP11725 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtcP11725 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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