Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa1P11477 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms