Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms