Protein–RNA interactions for Protein: P0C7A0

Khdc1b, KH homology domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1bP0C7A0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1bP0C7A0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms