Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LtaP09225 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LtaP09225 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LtaP09225 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LtaP09225 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LtaP09225 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LtaP09225 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LtaP09225 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LtaP09225 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LtaP09225 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LtaP09225 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LtaP09225 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LtaP09225 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LtaP09225 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LtaP09225 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LtaP09225 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LtaP09225 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LtaP09225 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtaP09225 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtaP09225 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtaP09225 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtaP09225 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtaP09225 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtaP09225 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtaP09225 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtaP09225 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtaP09225 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtaP09225 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtaP09225 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LtaP09225 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtaP09225 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtaP09225 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtaP09225 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtaP09225 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtaP09225 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtaP09225 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtaP09225 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtaP09225 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtaP09225 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtaP09225 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtaP09225 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtaP09225 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtaP09225 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtaP09225 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtaP09225 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtaP09225 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LtaP09225 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LtaP09225 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LtaP09225 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LtaP09225 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
LtaP09225 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
LtaP09225 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LtaP09225 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LtaP09225 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LtaP09225 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LtaP09225 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LtaP09225 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LtaP09225 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LtaP09225 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms