Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TnfP06804 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TnfP06804 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TnfP06804 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TnfP06804 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TnfP06804 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TnfP06804 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TnfP06804 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TnfP06804 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TnfP06804 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TnfP06804 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TnfP06804 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TnfP06804 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TnfP06804 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TnfP06804 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TnfP06804 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TnfP06804 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TnfP06804 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TnfP06804 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TnfP06804 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TnfP06804 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TnfP06804 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TnfP06804 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TnfP06804 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnfP06804 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnfP06804 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnfP06804 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnfP06804 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnfP06804 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnfP06804 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnfP06804 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnfP06804 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnfP06804 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TnfP06804 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnfP06804 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TnfP06804 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnfP06804 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnfP06804 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnfP06804 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnfP06804 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnfP06804 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnfP06804 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnfP06804 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnfP06804 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnfP06804 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnfP06804 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnfP06804 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TnfP06804 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TnfP06804 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TnfP06804 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TnfP06804 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TnfP06804 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TnfP06804 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TnfP06804 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TnfP06804 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TnfP06804 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TnfP06804 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TnfP06804 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TnfP06804 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TnfP06804 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TnfP06804 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TnfP06804 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TnfP06804 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TnfP06804 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TnfP06804 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TnfP06804 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TnfP06804 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TnfP06804 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TnfP06804 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnfP06804 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnfP06804 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms