Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
P04212 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P04212 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P04212 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P04212 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
P04212 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P04212 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P04212 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P04212 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P04212 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P04212 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P04212 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
P04212 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P04212 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P04212 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P04212 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P04212 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P04212 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P04212 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P04212 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12□□□□□ -0.49
P04212 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04212 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04212 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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