Protein–RNA interactions for Protein: P01843

Ig lambda-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01843 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01843 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01843 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01843 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01843 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01843 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01843 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01843 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01843 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01843 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01843 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01843 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01843 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01843 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01843 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01843 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01843 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01843 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01843 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms