Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01790 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01790 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01790 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01790 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01790 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01790 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01790 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01790 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01790 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01790 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01790 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01790 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01790 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01790 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01790 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01790 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01790 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01790 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01790 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01790 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01790 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01790 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01790 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01790 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01790 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01790 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms