Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01648 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01648 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01648 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01648 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01648 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01648 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01648 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01648 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01648 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
P01648 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01648 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01648 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P01648 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01648 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01648 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01648 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01648 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01648 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01648 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01648 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01648 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01648 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01648 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01648 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01648 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01648 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01648 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01648 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01648 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01648 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01648 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01648 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01648 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01648 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01648 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01648 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01648 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01648 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms