Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Casp8O89110 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Casp8O89110 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Casp8O89110 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Casp8O89110 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Casp8O89110 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Casp8O89110 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Casp8O89110 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casp8O89110 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Casp8O89110 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Casp8O89110 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Casp8O89110 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casp8O89110 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Casp8O89110 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Casp8O89110 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Casp8O89110 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Casp8O89110 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Casp8O89110 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Casp8O89110 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Casp8O89110 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casp8O89110 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Casp8O89110 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casp8O89110 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Casp8O89110 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp8O89110 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Casp8O89110 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms