Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ShdO88834 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ShdO88834 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ShdO88834 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ShdO88834 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ShdO88834 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ShdO88834 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ShdO88834 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ShdO88834 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ShdO88834 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ShdO88834 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ShdO88834 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ShdO88834 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShdO88834 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ShdO88834 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ShdO88834 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ShdO88834 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ShdO88834 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ShdO88834 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ShdO88834 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ShdO88834 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
ShdO88834 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ShdO88834 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ShdO88834 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ShdO88834 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ShdO88834 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ShdO88834 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ShdO88834 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ShdO88834 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ShdO88834 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ShdO88834 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ShdO88834 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ShdO88834 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ShdO88834 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ShdO88834 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ShdO88834 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ShdO88834 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ShdO88834 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ShdO88834 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
ShdO88834 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ShdO88834 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ShdO88834 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ShdO88834 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ShdO88834 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ShdO88834 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ShdO88834 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ShdO88834 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ShdO88834 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ShdO88834 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ShdO88834 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ShdO88834 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ShdO88834 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ShdO88834 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ShdO88834 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ShdO88834 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ShdO88834 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms