Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnk4O88454 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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