Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm10509O88255 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Gm10509O88255 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Gm10509O88255 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Gm10509O88255 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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