Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top3aO70157 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Top3aO70157 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Top3aO70157 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3aO70157 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top3aO70157 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top3aO70157 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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