Protein–RNA interactions for Protein: O55208

Figla, Factor in the germline alpha, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FiglaO55208 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FiglaO55208 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FiglaO55208 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FiglaO55208 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FiglaO55208 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FiglaO55208 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FiglaO55208 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FiglaO55208 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FiglaO55208 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FiglaO55208 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms