Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms