Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6bO54951 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms