Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms