Protein–RNA interactions for Protein: O35973

Per1, Period circadian protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per1O35973 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Per1O35973 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Per1O35973 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Per1O35973 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Per1O35973 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Per1O35973 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Per1O35973 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Per1O35973 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Per1O35973 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Per1O35973 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Per1O35973 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Per1O35973 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Per1O35973 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Per1O35973 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Per1O35973 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Per1O35973 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Per1O35973 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Per1O35973 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Per1O35973 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Per1O35973 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Per1O35973 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Per1O35973 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Per1O35973 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Per1O35973 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Per1O35973 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Per1O35973 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Per1O35973 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Per1O35973 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Per1O35973 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Per1O35973 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Per1O35973 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Per1O35973 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Per1O35973 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Per1O35973 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Per1O35973 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Per1O35973 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Per1O35973 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Per1O35973 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Per1O35973 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Per1O35973 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Per1O35973 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Per1O35973 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Per1O35973 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Per1O35973 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Per1O35973 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Per1O35973 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Per1O35973 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Per1O35973 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Per1O35973 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Per1O35973 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Per1O35973 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Per1O35973 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Per1O35973 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Per1O35973 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Per1O35973 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Per1O35973 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Per1O35973 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Per1O35973 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Per1O35973 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Per1O35973 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Per1O35973 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Per1O35973 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Per1O35973 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Per1O35973 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Per1O35973 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Per1O35973 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Per1O35973 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Per1O35973 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Per1O35973 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Per1O35973 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Per1O35973 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Per1O35973 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Per1O35973 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Per1O35973 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Per1O35973 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Per1O35973 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Per1O35973 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Per1O35973 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Per1O35973 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Per1O35973 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Per1O35973 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Per1O35973 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Per1O35973 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Per1O35973 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Per1O35973 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Per1O35973 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Per1O35973 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Per1O35973 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Per1O35973 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Per1O35973 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Per1O35973 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Per1O35973 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Per1O35973 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Per1O35973 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Per1O35973 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Per1O35973 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Per1O35973 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms