Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Pik3cdO35904 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pik3cdO35904 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pik3cdO35904 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pik3cdO35904 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pik3cdO35904 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pik3cdO35904 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pik3cdO35904 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pik3cdO35904 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pik3cdO35904 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pik3cdO35904 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pik3cdO35904 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pik3cdO35904 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pik3cdO35904 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pik3cdO35904 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pik3cdO35904 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pik3cdO35904 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pik3cdO35904 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pik3cdO35904 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pik3cdO35904 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pik3cdO35904 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pik3cdO35904 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pik3cdO35904 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pik3cdO35904 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pik3cdO35904 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pik3cdO35904 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pik3cdO35904 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pik3cdO35904 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pik3cdO35904 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pik3cdO35904 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pik3cdO35904 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pik3cdO35904 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pik3cdO35904 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pik3cdO35904 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pik3cdO35904 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pik3cdO35904 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pik3cdO35904 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pik3cdO35904 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pik3cdO35904 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pik3cdO35904 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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