Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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Sp100O35892 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Sp100O35892 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Sp100O35892 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Sp100O35892 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Sp100O35892 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sp100O35892 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sp100O35892 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sp100O35892 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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