Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn6O35646 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn6O35646 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn6O35646 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn6O35646 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn6O35646 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capn6O35646 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn6O35646 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn6O35646 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn6O35646 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capn6O35646 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn6O35646 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn6O35646 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn6O35646 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capn6O35646 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn6O35646 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn6O35646 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn6O35646 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn6O35646 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn6O35646 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn6O35646 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn6O35646 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn6O35646 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Capn6O35646 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn6O35646 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Capn6O35646 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn6O35646 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn6O35646 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Capn6O35646 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn6O35646 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn6O35646 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Capn6O35646 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Capn6O35646 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn6O35646 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Capn6O35646 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn6O35646 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn6O35646 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn6O35646 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn6O35646 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn6O35646 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn6O35646 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn6O35646 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn6O35646 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Capn6O35646 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn6O35646 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn6O35646 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn6O35646 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn6O35646 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn6O35646 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn6O35646 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn6O35646 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn6O35646 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn6O35646 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn6O35646 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn6O35646 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn6O35646 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn6O35646 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn6O35646 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn6O35646 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn6O35646 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn6O35646 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn6O35646 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn6O35646 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn6O35646 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn6O35646 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn6O35646 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn6O35646 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn6O35646 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms