Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Opn1mwO35599 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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