Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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