Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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