Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf11aO35305 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms