Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad6O35182 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad6O35182 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad6O35182 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad6O35182 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad6O35182 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms