Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx3O35160 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms