Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps1O08983 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps1O08983 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hps1O08983 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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