Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gfra2O08842 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms