Protein–RNA interactions for Protein: O08638

Myh11, Myosin-11, mousemouse

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Length 1,972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh11O08638 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myh11O08638 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myh11O08638 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Myh11O08638 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Myh11O08638 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms