Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MttpO08601 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MttpO08601 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms