Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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