Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccer2J3QPU5 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms