Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm5294J3QP53 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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