Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim18J3QNP2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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