Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm17577J3QNF7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms