Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gm11236J3QMS7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gm11236J3QMS7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gm11236J3QMS7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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