Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm20873J3QMQ9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm20873J3QMQ9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm20873J3QMQ9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm20873J3QMQ9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm20873J3QMQ9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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