Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms