Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
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