Protein–RNA interactions for Protein: F6VBM2

Gm10490, Predicted gene 10490, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10490F6VBM2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10490F6VBM2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10490F6VBM2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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