Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
6030445D17RikE9Q8F9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms