Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms