Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms